Genètica i conservació del lliri asiàtic Lilium cernuum |
|
|
|
dimecres, 10 de gener de 2018 10:24 |
Lilium cernuum és una espècie localment amenaçada però que té cultivars emprats en jardineria ornamental
Amb els primers dies de l'any, amb data 4 de gener de 2018, s'ha publicat electrònicament a la prestigiosa revista PLoS ONE l'article que signen els nostres companys Jordi López i Sònia Herrando sobre refugis glacials del lliri sino-coreà Lilium cernuum, llistat com a amenaçat a Xina i Rússia.
Per mitjà d'electroforesi d'al·loenzims, es comparen poblacions del N de l'area de distribució (Xina) i del S (Corea), que confirmen el paper de les muntanyes de Baekdudaegan (BDDG) a la península de Corea com a refugi glacial de genotips d'aquest lliri expandits des del nord, amb nivells de diversitat en congruència amb la modelització d'hàbitats i l'evolució postglacial. Les poblacions del més australs de Corea del Sud són les més mereixedores de conservació.
La representació de la comparació dels resultats genètics amb el programari STRUCTURE mostra la diferenciació en dos grups (K=2) que corresponen a les poblacions del N i del S de l'àrea de distribució. [CC BY 4.0 Chung MY, Vu SH, López-Pujol J, Herrando-Moraira S, Son S, Suh GU, et al. (2018)]
L'estudi s'ha fet en col·laboració amb investigadors coreans i amb finançament del “Infrastructure for Conservation and Restoration of Rare and Endemic Plants in Korea National Arboretum” i el "Basic Science Research Program" de la National Research Foundation of Korea (NRF).
Més informació
- Chung MY, Vu SH, López-Pujol J, Herrando-Moraira S, Son S, Suh GU, et al. (2018) Comparison of genetic variation between northern and southern populations of Lilium cernuum (Liliaceae): Implications for Pleistocene refugia. PLoS ONE 13(1): e0190520. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0190520
|
Darrera actualització de dimecres, 10 de gener de 2018 10:56 |
Nou vídeo promocional de l'IRBio |
|
|
|
dimecres, 13 de desembre de 2017 15:49 |
Els serveis audiovisuals de la Universitat de Barcelona han produït un nou vídeo promocional on es presenta l'àmbit d'actuació de l'Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBio) al qual pertanyen investigadors del BioC, que també participen en la presentació.
Veure vídeo - Enllaç IRBio/UB |
Dades genètiques 2017, al BDBC |
|
|
|
dijous, 30 de novembre de 2017 12:14 |
Avui s'han presentat al coordinador del Banc de Dades de Biodiversitat de Catalunya (BDBC), Dr. Xavier Font, les dades corresponents a 2017 per als mòduls de diversitat genètica CromoCat i GenoCat.
El treball ha consistit en la captura de dades durant 2017 per a ser introduïdes a l'apartat de flora del BDBC i hi han participat el membres del BioC Joan Simon, Cèsar Blanché, amb la col·laboració del becari Sergi Casanova, sota la direcció de Joan Simon.
Enguany s'han aportat 1136 nous registres de CromoCat (nombres cromosòmics) i 462 de GenoCat (diversitat genètica molecular), incloent-hi dades genètiques i registes bibliogràfics. El total de registres acumulats als mòduls a data d'avui és de gairebé 80.000 registres (79.845: 58.457 registres a CromoCat i 21.388 a GenoCat).
Més informació
- Banc de Dades de Biodiversitat de Catalunya (BDBC) - enllaç
|
Jordi López i Sergi Massó, al seminari IBB |
|
|
|
dimarts, 28 de novembre de 2017 14:35 |
Jordi López, durant la seva participació al Seminari IBB (Foto C. Blanché)
Aquest matí ha tingut lloc a l’Institut Botànic de Barcelona el seminari Radiacions alpines de tipus insular a l’Àsia: primers resultats en el gènere Saussurea i ecos de l’ expedició al seu centre de distribució, las muntanyes Hengduan, a càrrec d’Alfonso Susanna, i dels nostres companys del BioC, Sergi Massó i Jordi López-Pujol.
Durant la sessió s’ha presentat el projecte de recerca internacional d’estudi de les radiacions de tipus alpí a la tribu de les Cardueae (Compositae), basat en l’ús de la tecnologia NGS (New Generation Sequences), que permet una altíssima resolució en les filogènies (més de 1.000 gens analitzats) i que des d’ara es troba disponible a l’Institut Botànic de Barcelona. El projecte inclou investigadors d’institucions de la Xina, Finlàndia, França, Iran, Japó, Corea, Rússia així com d’institucions espanyoles i també catalanes (UAB, Institut Botànic). Les primeres proves pilot han donat uns resultats molt esperançadors perquè han millorat moltíssim les resolucions de les filogènies anteriors.
També s’han presentat les característiques del territori on s’ha de dur a terme l’estudi: les muntanyes de Hengduan, com a centre de diversitat del gènere Saussurea (s’hi inclou la que possiblement és l’espècie que colonitza hàbitats de més altitud, S. medusa, per damunt dels 6.000 m). Es tracta de l’extrem occidental de les altes muntanyes xineses, amb una extensió de c. 500.000 km2(equivalent a l'estat espanyol) i una elevació mitjana de 4.000 m s.m., molt inaccessible i que fa del mostratge en sí mateix una dificultat de gran magnitud.
Finalment, s’ha destacat l’interès en conservació del territori: un dels hotspots de biodiversitat del planeta, amb mes de 12.000 espècies de flora, 3.500 de les quals en són endèmiques (29,2 %) i una concentració extraordinària de gimnospermes (20 espècies endèmiques del territori). Però, a més, és una zona sota amenaces de tota mena, amb espècies críticament amenaçades, com ara Acer yangbiense (CR, només 5 individus romanents) o Pinus squamata (CR, només 32 individus) i amb les poques zones protegides sotemeses a una fortíssima pressió: el Parc Nacional de Jiuzhaigou, amb més de 5 milions de visitants a l’any pateix una excessiva sobrefreqüentació que amenaça els seus valors naturals. |
Reconeixement a les bases de dades del BioC |
|
|
|
divendres, 24 de novembre de 2017 10:18 |
La prestigiosa revista Plant Systematics and Evoution acaba de publicar la presentació d'una nova base de dades cromosòmica, en aquest cas, de la flora de l'Alemanya. (Paule et al., 2017). D'entre els models estudiats com a referència prèvia a la construcció de la nova base de dades relacional figuren les produccions del BioC de CromoCat i DCDB (Delphinieae Chromosome Database).
El projecte “Chromosome numbers of the Flora of Germany” (títol bilingüe, també en en anglès, amb intenció clara de servei internacional) es descriu a Paule et al (2017) i és disponible a http://plantchromosomes.senckenberg.de/ [accés 23/11/2017]. Finançat per una agència estatal (Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG)), és dut a terme per un consorci d’institucions de recerca del SGN (Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung) que agrupa sis instituts de recerca i tres museus d’Alemanya); el nucli del l’equip del banc de dades cromosòmiques és format pel Departament de Botànica i Evolució Molecular, a Senckenberg Frankfurt, Departament de Botànica a Senckenberg Görlitz i el Data and Modelling Centre al Senckenberg BiK-F Frankfurt. Ha estat construït sobre les darreres versions del programari de PostgreSQL/GIS, DaDaBIK, GeoServer i OpenLayers.
El llançament del projecte s’acaba de presentar enguany (Paule et al., 2017) amb més de 12.000 registres de 1748 espècies de 858 fonts bibliogràfiques. Tot i que el conjunt de la flora alemanya és força més pobre en espècies que la flora catalana, contràriament, la tradició i l’esforç d’estudi cromosòmic de la flora és molt superior.
Més informació
- Paule J, Gregor T, Schmidt M, Gerstner E-M, Dersch G, Dressler S, Wesche K, Zizka G 2017. Chromosome numbers of the flora of Germany – a new online database of georeferenced chromosome counts and flow cytometric ploidy estimates. Plant Systematics and Evolution 303(8):1123-1129, doi:10.1007/s00606-016-1362-y (enllaç a l'article)
- Bosch M, Simon J, López J-Pujol, Blanché C (2016) DCDB: an updated on-line database of chromosome numbers of tribe Delphinieae (Ranunculaceae). Enllac a: http://hdl.handle.net.sire.ub.edu/2445/98702
- Simon J, Margelí M, Blanché C (2001) CROMOCAT: the chromosome database of the catalan Countries. Bocconea 13:281–297 Google Scholar
|
Darrera actualització de dimarts, 28 de novembre de 2017 14:45 |
|
|